DB37/T 3560-2019 荷斯坦牛致死单倍型(HH1、HH3、HH4和HH5)基因检测技术规程
DB37/T 3560-2019 The technical specification for detecting the heifer-killing haplotypes (HH1, HH3, HH4, and HH5) of Holstein cattle using genetic testing techniques
基本信息
发布历史
-
2019年05月
研制信息
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- 起草人:
- 出版信息:
- 页数:13页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS65.020.01
B40
DB37
山东省地方标准
DB37/T3560—2019
荷斯坦牛致死单倍型(HH1、HH3、HH4和HH5)
基因检测技术规程
Codeofpracticeformoleculardetectionoflethalhaplotypes(HH1,HH3,HH4and
HH5)inHolstein
2019-05-29发布2019-06-29实施
山东省市场监督管理局发布
DB37/T3560—2019
目次
前言................................................................................II
1范围...............................................................................1
2规范性引用文件.....................................................................1
3术语和定义.........................................................................1
4检测原理...........................................................................2
4.1荷斯坦牛致死单倍型HH1、HH3和HH4的检测........................................2
4.2荷斯坦牛致死单倍型HH5的检测...................................................2
5主要试剂...........................................................................2
6主要仪器设备.......................................................................2
7检测方法...........................................................................2
7.1样本采集.......................................................................2
7.2DNA提取........................................................................2
7.3DNA浓度和纯度检测..............................................................3
7.4引物序列.......................................................................3
7.5PCR扩增........................................................................3
7.6PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测......................................................3
7.7测序分析.......................................................................3
8结果判定...........................................................................3
8.1致死单倍型HH1测序结果判定与表述...............................................3
8.2致死单倍型HH3测序结果判定与表述...............................................4
8.3致死单倍型HH4测序结果判定与表述...............................................4
8.4致死单倍型HH5扩增条带判定与表述...............................................5
9废弃物的处理.......................................................................5
10检测过程中防止交叉污染的措施......................................................5
附录A(资料性附录)主要试剂....................................................6
附录B(资料性附录)主要仪器设备................................................7
附录C(规范性附录)PCR扩增产物.................................................9
I
DB37/T3560—2019
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由山东省畜牧兽医局提出并监督实施。
本标准由山东省畜牧业标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:山东省农业科学院奶牛研究中心、山东省畜牧总站、威海市畜牧兽医局、山东奥
克斯畜牧种业有限公司、江苏省农业科学院畜牧研究所。
本标准主要起草人:黄金明、鞠志花、王秀革、张思聪、赵国清、高亚平、魏晓超、姜强、刘文浩、
张亚冉、李荣岭、李建斌、高运东、曲绪仙、侯明海、仲跻峰。
II
DB37/T3560—2019
荷斯坦牛致死单倍型(HH1、HH3、HH4和HH5)基因检测技术规程
1范围
本标准规定了荷斯坦牛四种致死单倍型(HH1、HH3、HH4和HH5)的检测方法和结果判定。
本标准适用于荷斯坦牛四种致死单倍型(HH1、HH3、HH4和HH5)的检测与诊断。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
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NY/T2695—2015牛遗传缺陷基因检测技术规程
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3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
荷斯坦致死单倍型1Holsteinlethalhaplotype1,HH1
由牛第5号染色体的凋亡蛋白酶激活因子1(Apoptoticprotease-activatingfactor1,APAF1)
基因产生的终止突变(g.63150400C>T;rs448942533;牛参考基因组UMD3.1)引起的一种隐性遗传缺
陷。当突变等位基因纯合时,个体致死,大多数表现为妊娠早期流产,不易被观察,在健康奶牛群体中
无纯合的HH1单倍型。
3.2
荷斯坦致死单倍型3Holsteinlethalhaplotype3,HH3
由牛第8号染色体的染色体结构维持2(Structuralmaintenanceofchromosomes2,SMC2)基因
一个错义突变(g.95410507T>C;rs456206907;牛参考基因组UMD3.1)引起的一种隐形遗传缺陷,与
乳蛋白、繁殖年限、青年牛受胎率、母牛受胎率有关,当突变的等位基因纯合时致死。
3.3
荷斯坦致死单倍型4Holsteinlethalhaplotype4,HH4
1
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