DB22/T 2083-2014 食用菌菌种真实性鉴定 RAMP法
DB22/T 2083-2014 DB22/T 2083-2014 Edible Mushroom Germplasm Authentication RAMP Method
基本信息
发布历史
-
2014年05月
研制信息
- 起草单位:
- 起草人:
- 出版信息:
- 页数:14页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS65.020
B61
DB22
吉林省地方标准
DB22/T2083—2014
食用菌菌种真实性鉴定RAMP法
Verificationofgenuinenessforediblemushroomspawn—RAMP
2014-05-04发布2014-06-01实施
吉林省质量技术监督局发布
DB22/T2083—2014
前言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2001给出的规则起草。
本文件的某些内容可能涉及专利,本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本标准由吉林省农业委员会提出并归口。
本标准起草单位:吉林农业大学。
本标准主要起草人:宋慧、刘晓龙、金周雨、汤海峰、宗立立、李雨婷、王健、谭旭华、李艳丽。
I
DB22/T2083—2014
食用菌菌种真实性鉴定RAMP法
1范围
本标准规定了利用RAMP技术鉴定食用菌菌种真实性的分析步骤、结果记录、分析鉴定的方法。
本标准适用于猴头菌(Hericiumerinaceus)、小刺猴头菌(Hericiumcaput-medusae)、珊瑚状
猴头菌(HericiumcoralloidesPers)、黑木耳(Auriculariaauricular)和光帽鳞伞(Pholiotanameko)
食用菌菌种真实性的鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T12728食用菌术语
3术语和定义
GB/T12728界定的以及下列术语和定义适用于本文件。
3.1
随机扩增微卫星DNA多态性标记RandomAmplifiedMicrosatellitePolymorphism(RAMP)
是以1条与微卫星序列互补的SSR引物和1条RAPD随机引物相组合,对基因组中的微卫星序列与
随机引物互补序列之间的DNA片段进行随机扩增的技术。
3.2
菌种真实性VerificationofSpawn
供检菌种与对照菌种的符合性
4RAMP标记原理
采用RAMP标记扩增基因组中微卫星序列与随机引物互补序列之间的DNA片段,通过比较试样与对照
指纹图谱,从而对菌种进行鉴定。
5仪器设备及试剂
见附录A。
6溶液配制
1
DB22/T2083—2014
见附录B。
7分析步骤
7.1菌丝培养
7.1.1培养基的制备
称取去皮马铃薯200.0g,制备成均匀碎块(约1cm3),加蒸馏水1000mL,煮沸30min,滤除固体
残渣,在马铃薯汁液中加入葡萄糖20.0g,硫酸镁0.5g,磷酸二氢钾0.46g,磷酸氢二钾1.0g,琼
脂18.0g,加热使其充分溶解,定容至1000mL,pH自然,装入试管,塞好试管塞。121℃-126℃,高压
灭菌30min,摆成斜面冷却后使用。
7.1.2接种
将供检菌株与对照菌株在相同条件下培养,培养量可供做3个平行鉴定试验。将待供检菌株与对照
菌株在无菌条件下,切取(3~5)mm×(3~5)mm大小一块母种,迅速转移至试管斜面培养基中央位
置,每个菌株接种20支~30支试管。
7.1.3恒温培养
将接种后的试管置恒温培养箱中,分别在25℃条件下避光培养黑木耳9d~12d,猴头菌、小刺猴
头菌、珊瑚状猴头菌培养12d~15d;在20℃条件下避光培养光帽鳞伞15d~20d。
7.2DNA提取
7.2.1称取0.1g的菌丝置于无菌研钵中,在液氮中充分研磨成粉末;
7.2.2将菌丝粉末迅速转移至1.5mL离心管中,加入600µL的65℃预热的CTABDNA提取缓冲液,
置于65℃水浴45~60min,每5min~15min颠倒混匀;
7.2.3加入等体积苯酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)抽提10min,颠倒混匀,4℃,12000rpm离心5min;
7.2.4取上清加等体积氯仿-异戊醇(24:1)抽提10min,颠倒混匀,4℃,12000rpm离心5min,
重复7.2.4抽提1次;
7.2.5加等体积异丙醇-20℃充分沉淀;
7.2.64℃,5000rpm离心10min,弃上清;
7.2.7加500µL的70%乙醇洗涤沉淀2次,室温干燥,加40µL的TE缓冲液(pH8.0)溶解;
7.2.8加入10mg/mL的RNase溶液至终浓度达50μg/mL,去除RNA,37℃水浴1h;
7.2.9重复操作7.2.3~7.2.5,加入100μLTE缓冲液(pH8.0),使DNA充分溶解,并置于4℃冰
箱中保存备用
注:长期保存应采用-20℃;多次测定需分装保存,每次使用后不再重新冻存。
7.3DNA纯度检测
7.3.1电泳检测
取1%琼脂糖溶液40mL加入4µL的溴化乙锭,缓慢倒入凝胶托盘中冷却,避免出现气泡,插入
梳子,待胶体凝固后,缓慢拔出梳子,将凝胶托盘置于装有1×TAE缓冲液的水平电泳槽中;在凝胶点
样孔中加入5µL菌株DNA提取液与2µL的6×Loadingbuffer的混合液体,用5µL的λHindⅢMarker
作为参照;采用100V恒压电泳,待溴酚蓝前沿指示剂移动到距凝胶前沿0.5cm~1cm处,停止电泳
2
DB22/T2083—2014
(约1h);在凝胶成像系统中观察并照相;电泳条带应呈现单一清晰状态,否则重新提取DNA。
7.3.2紫外检测
取3µLDNA提取液,用无菌水稀释至一定倍数,混匀后,加入石英比色皿中,加入量为比色皿体
积的3/4,并以无菌水或TE缓冲液为空白对照,用紫外-可见分光光度计分别在260nm和280nm下测量其
OD值,计算OD260/OD280比值,如果该比值在1.6~1.8之间,可以进行PCR反应,否则重新提取DNA。
待测样品含量(µg/mL)=OD260值×稀释倍数×50
7.4PCR扩增
7.4.1RAMP引物及其使用
由4条SSR引物和10条RAPD引物组成40对核心引物。使用时首先选用5对参见附
定制服务
推荐标准
- DB63/T 908-2010 机械化地膜覆盖技术操作规程 2010-08-04
- DB63/T 893-2010 青稞 昆仑13号 2010-08-04
- DB63/T 894-2010 莜麦 晋九 2010-08-04
- DB63/T 898-2010 马铃薯 民薯2号 2010-08-04
- DB63/T 895-2010 莜麦 坝莜6号 2010-08-04
- DB63/T 910-2010 机械化深松技术操作规程 2010-08-04
- DB32/T 396-2010 洞庭山碧螺春茶园管理技术 2010-08-05
- DB32/T 419-2010 海蜜二号厚皮甜瓜栽培技术规程 2010-08-05
- DB31/T 487-2010 家庭病床服务规范 2010-06-23
- DB31/T 490-2010 旅游集散中心服务质量要求 2010-07-13