GB/T 36833-2018 马铃薯X病毒检疫鉴定方法
GB/T 36833-2018 Detection and identification of Potato virus X
基本信息
本标准适用于可能带有马铃薯X病毒的马铃薯植株、繁殖材料及其他寄主植物的检疫鉴定。
发布历史
-
2018年09月
研制信息
- 起草单位:
- 中华人民共和国黑龙江出入境检验检疫局、中华人民共和国中山出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、浙江大学、中华人民共和国山东出入境检验检疫局
- 起草人:
- 刘洪义、刘忠梅、车瑞丰、陈定虎、魏梅生、张星哲、李桂芬、张永江、吴建祥、封立平、袁建江、杨立群
- 出版信息:
- 页数:19页 | 字数:36 千字 | 开本: 大16开
内容描述
ICS65.020.01
B16
国
中华人民共和国国家标准
GB/T36833-2018
马铃薯X病毒检疫鉴定方法
DetectionandidentificationofPotatovirusX
2018-09-17发布2019-04-01实施
国家市场监督管理总局峪非
中国国家标准化管理委员会0(..'I(J
GB/T36833-2018
目lj昌
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国黑龙江出入境检验检疫局、中华人民共和国中山出入境检验检疫
局、中国检验检疫科学研究院、晰江大学、中华人民共和国山东出入境检验检疫局。
本标准主要起草人:刘洪义、刘忠梅、车瑞丰、陈定虎、魏梅生、张星哲、李桂芬、张永江、吴建祥、
封立平、袁建江、杨立群。
I
GB/T36833-2018
C.2.2RT-PCR反应
C.2.2.1引物序列
表C.1RT-PCR检测的引物序列
引物名称可|物序列
PVX-RT-F
5’-GCTG八八CGGTTAAGTTTCCATTGAT八C-3'
PVXRTR51CGTAGTTATGGTGGTGGGAGAGTG-3'
C.2.2.2反转录合成cDNA
反转录体系见表C.2。
表C.2反转录体系
试剂l名称加lJ佯休积/µL
RNA2
20,umol/LPVX-RT-Rl
在70℃满育5min,然后立即置于冰上;放置5min
4
5×反转录反应缓冲液
10mmol/LdNTPsl
40U/µLRNA酶抑制齐I0.5
200U/µLM-MLV反转录酶l
DEPC-H,O补足至20
反应参数:42℃,45min;95℃,10min。合成的cDNA置于一20℃保存备用。也可采用RT-PCR
一步法试剂盒,操作步骤按使用说明进行。
C.2.2.3PCR反应
PCR反应体系见表C.30反应参数:95°C4min;95℃30日,58℃30日,72°C50s,35个循环;
72℃5mino
表C.3PCR反应体系
试剂名称1111样体积/µL
JO×PCR反应缓冲浪2.5
25mmol/LMgCl2C反应缓冲液中已含有的可不力II人)2.5
lOmmot/LdNTPsl
20µmol/LPVX-RT-Fl
20,umol/LPVX-RT-Rl
5U/µLT<1qDNA聚合酶0.2
9
GB/T36833-2018
表C.3(续)
试剂名称;JU样体积/µL
2
cDNA模板
25
ddH20补足至
C.2.3琼脂糖;疑胶电泳检测
将制胶板同制好的琼脂糖凝胶一并放入水平电泳槽,取5µL扩增反应物加1µL的6×澳酣蓝上
样缓冲液?昆匀,以及5,uLDNAMarker作为分子量标准物分别点入样孔内。电泳缓冲液1×TAE适
量,100V,电泳30min。电泳结束后,放入0.5µg/mL澳化乙键(或其替代物)溶液中染色10min,将整
个凝胶置于凝胶成像系统上拍照,记录结果。
C.3结果判断
C.3.1阳性对照在753bp左右处有扩增片段,阴性对照和空白对照元特异性扩增,待测样品出现与阳
性对照一致的扩增条带,可判定为阳性。
C.3.2阳性对照在753bp左右处有扩增片段,阴性对照和空白对照元特异性扩增,待测样品在753bp
左右处无扩增条带,判定结果为阴性。
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GB/T36833-2018
附录D
(规范性附录)
Real-timeRT-PCR检测
D.1Real-timeRT-PCR试剂
一步法RT-PCR反应缓冲液(TaqManOne-stepRT-PCRMixture)。
D.2实验步骤
D.2.1总RNA提取
总RNA提取同C.2.1。
D.2.2引物合成
引物序列见表D.L
表D.1Real-timeRT-PCR检测的引物序列
序列(5’-3’)
可|物名称
PVXTmF5’-i\GGCTi\TCTGGAAGGACi\TGAi\-3'
PVXTmR5’-TGAGCAGATG八GCCCJ\CAT-3’
PVX探针5'-Fi\M-CCCACJ\GACACTi\TGGC八CAGGCTG-Tamra-3'
D.2.3Real-timeRT-PCR反应
反应体系:0.2mL离心管中力[I入2×一步法RT-PCR缓冲液山(OneStepRT-PCRBufferIll)
10µL,E.TT的IHS(5U/µL)0.4µL,PrimeScriptRT酶混合液ll(PrimeScriptRTEnzymeMixII)
0.4µL,PVX-Tm-F(lOµmol/L)0.4µL,PVX-Tm-R(10/,!mol/L)0.4µL,PVX-探针(10/,!ffiOI/L)
0.6J,!L,ROX参比染料II(ROXReferenceDyeII)0.4J,!L,模板RNA2/,!L,补DEPC-H20至20µL。
设置阳性对照、阴性对照及空白对照。
反应程序:42℃10min;95·c10s;95℃5日,60℃34日,45个循环。
PCR反应体系中各种试剂的量可根据具体情况进行适当调整,也可采用商业化试剂盒。
D.3结果判定
D.3.1基线的设置
Real-timeRT-PCR反应结束并分析结果后,应设置无效基线范围。基线范围选择在3个~15个
循环,如果有强阳性样本,应根据实际情况调整基线范围。
D.3.2检测结果的判定
在阳性对照、阴性对照和空白对照正确的前提下:
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GB/T36833-2018
一一检测样品的Ct值小于35,且出现特定的扩增曲线,判定结果为阳性。Ct值介于35~40时为
疑似阳性,需要重新进行测试,或采用其他方法进行验证。
检测样品的Ct值大于40,或未出现特定的扩增曲线,判定结果为阴性。
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GB/T36833-2018
附录E
(规范性附录)
RT-LAMP检测
E.1试剂
一步法RT-LAMP反应试剂盒,LAMP荧光目视检测试剂盒,纳米磁珠法提纯RNA试剂盒。
E.2实验步骤
E.2.1采用纳米磁珠试剂盒推荐的方法提取总RNA
E.2.1.1制样
取0.5g的带毒植物组织力I]入1mL抽提缓冲液进行研磨,以无病毒感染的植物作为阴性对照。
E.2.1.2清洗纳米磁珠
取出纳米磁珠到PCR管中,用ddH20反复清洗纳米磁珠3次,在磁铁的作用下吸去ddH20。
E.2.1.3结合
加入100/..tL的样品到PCR管中,用移掖枪吸吐混匀样品和纳米磁珠,室温下吸附。
E.2.1.4清洗
在磁铁的作用下移去上清液,纳米磁珠清洗3次。
E.2.1.5裂解
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