DB22/T 3224-2021 EGFR基因突变检测技术规范

DB22/T 3224-2021 DB22/T 3224-2021 EGFR gene mutation testing technical specification

吉林省地方标准 简体中文 现行 页数:10页 | 格式:PDF

基本信息

标准号
DB22/T 3224-2021
标准类型
吉林省地方标准
标准状态
现行
中国标准分类号(CCS)
国际标准分类号(ICS)
发布日期
2021-04-16
实施日期
2021-05-01
发布单位/组织
吉林省市场监督管理厅
归口单位
吉林省卫生健康委员会
适用范围
-

发布历史

研制信息

起草单位:
吉林大学第一医院
起草人:
出版信息:
页数:10页 | 字数:- | 开本: -

内容描述

ICS11.020

CCSC05

22

吉林省地方标准

DB22/T3224—2021

EGFR基因突变检测PCR技术规范

EGFRMutationDetectionPCRTechnologyStandard

2021-04–16发布2021-05-01实施

吉林省市场监督管理厅发布

DB22/T3224—2021

前言

本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定

起草。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。

本文件由吉林省卫生健康委员会提出并归口。

本文件起草单位:吉林大学

本文件主要起草人:姜艳芳、何佳雪、张鹏、刘思文、刘勇、邹红雁、胡馨元、胡欣彤。

I

DB22/T3224—2021

EGFR基因突变检测PCR技术规范

1范围

本文件规定了EGFR基因突变检测的样本要求、检测方法、生物安全要求、材料与试剂、数据处理、

结果判定、废弃物处理与防止污染的措施。

本文件适用于荧光PCR法检测组织样本中EGFR基因特定突变。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,

仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本

文件。

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

GB19489实验室生物安全通用要求

SN/T1193基因检验实验室技术要求

3术语和定义

本文件没有需要界定的术语和定义。

4缩略语

下列缩略语适用于本文件。

EGFR表皮生长因子受体(EpidermalGrowthFactorReceptor)

ctDNA循环肿瘤脱氧核糖核酸(CirculatingTumorDeoxyriboNucleicAcid)

FFPE福尔马林固定石蜡包埋组织(Formalin-FixedandParrffin-Embedded)

NTC无模板对照(NoTemplateControl)

5生物安全要求

采样及检测过程所涉及的实验操作应按GB19489规定执行。

6材料与试剂

6.1仪器与耗材

6.1.1II级生物安全柜。

6.1.2涡旋混合仪。

6.1.3恒温加热器(56℃~90℃可调)。

6.1.4恒温水浴锅(可达60℃)。

1

DB22/T3224—2021

6.1.5微量移液器:10µL、100µL、200µL、1000µL。

6.1.6微量带滤芯吸头:10µL、100µL、200µL、1000µL。

6.1.7医用冰箱:2℃~8℃、-20℃、-80℃。

6.1.8离心机:10mL转子,转速不低于10000g/min,可低温离心。

6.1.9离心机:1.5mL转子,转速不低于13000g/min,可低温离心。

6.1.10实时荧光定量PCR仪。

6.1.11离心管:200µL、1.5mL、2mL、10mL、15mL。

6.2试剂

6.2.1除另有规定,本方法试验用水应符合GB/T6682规定的二级水,所用化学试剂均为分析纯。

6.2.2核酸提取试剂。

6.2.3荧光PCR试剂。

6.2.4无水乙醇。

6.2.5异丙醇。

6.2.6二甲苯。

6.2.7RNaseA。

6.2.8TE缓冲液。

7样本

7.1采集

7.1.1组织样本

石蜡包埋病理组织或切片样品应确定含有肿瘤病变细胞,将石蜡包埋病理组织或切片样品切成厚度

22

为5µm的切片,FFPE样本的组织面积应介于0.5cm~1cm,切片用量为5片。

7.1.2外周血样本

10mL,使用streck管采集,不可使用肝素抗凝剂。

7.1.3记录

样本接收记录表参见附录A。

7.2保存与运输

7.2.1FFPE样本保存在2℃~8℃低温运输,最长可以保存3年。

7.2.2streck管血液样本避光常温运输,忌暴晒、冷冻,在室温下最多可以保存3d。

8检测

8.1在试剂准备间生物安全柜内进行以下操作:

a)根据样本类型,按照样本数+2(阳性和阴性对照品各一)配制反应体系;

b)将配好的PCR体系转移至样本制备间;

8.2在样本制备间生物安全柜内进行以下操作:

2

DB22/T3224—2021

a)组织样本:刮取5片FFPE样品至1.5mL离心管中,通过脱蜡、去除RNA、柱提法等步骤提取

DNA并进行洗脱及纯化,获得可用于荧光PCR反应的待检DNA,待检的样品的DNA浓度为1.5~

3ng/µL;

b)血液样本通过进行离心、去除RNA、柱提法等步骤提取ctDNA并进行洗脱及纯化,获得可用于

荧光PCR反应的待检ctDNA;

c)根据样本类型,将适量已提取的DNA与PCR反应体系进行混合;同时设置NTC阴性和阳性对

照;

8.3在扩增间进行如下操作:

a)实时荧光定量PCR仪中进行PCR反应,组织样本检测参数见表1。

表1组织样本荧光PCR参数

温度

步骤时间循环数

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