DB63/T 1479-2016 青海草地早熟禾SSR分子标记鉴定技术规程
DB63/T 1479-2016 DB63/T 1479-2016 Standard for SSR Molecular Marker Identification of Poa alpine in Qinghai Grassland
基本信息
发布历史
-
2016年03月
研制信息
- 起草单位:
- 中国科学院西北高原生物研究所
- 起草人:
- 窦全文、赵闫闫、王海庆、汪新川、喻凤、李媛、刘瑞娟、陈志国、刘德梅
- 出版信息:
- 页数:11页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS65.020.20
B21
备案号:49251-2016DB63
青海省地方标准
DB63/T1479—2016
青海草地早熟禾
SSR分子标记鉴定技术规程
2016-03-21发布2016-05-01实施
青海省质量技术监督局发布
DB63/T1479—2016
前言
本规程按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本规程由中国科学院西北高原生物研究所提出并归口。
本规程负责起草单位:中国科学院西北高原生物研究所。
本规程主要起草人:窦全文、赵闫闫、王海庆、汪新川、喻凤、李媛、刘瑞娟、陈志国、刘德梅。
I
DB63/T1479—2016
青海草地早熟禾SSR分子标记鉴定技术规程
1范围
本规程规定了青海草地早熟禾品种真实性和纯度SSR分子标记鉴定的设备、试剂配制、操作程序、
SSR引物以及判定原则等技术内容。
本规程适用于种子管理部门、农业科研、教学、生产、推广等单位对多年生牧草品种青海草地早熟
禾真实性及纯度的鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样
3缩略语
下列缩略语适用于本文件。
SSR:简单重复序列
DNA:脱氧核糖核酸
dNTPs:四种脱氧核糖核苷酸
PCR:聚合酶链式反应
4仪器、设备与试剂
仪器、设备与试剂见附录A。
5试剂配制
5.1DNA提取试剂
5.1.1乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA)溶液
称取EDTA-Na2·2H2O9.306g,加去离子水35mL,剧烈搅拌,用NaOH颗粒0.80g~1.11g调pH至8.0,
定容至50mL,终浓度为0.5mol/L。
5.1.2三羟甲基氨基甲烷盐酸(Tris-HCl)溶液
称取Tris6.060g,加超纯水40mL溶解,滴加浓HCl1.8mL~2.2mL调pH至8.0,定容至50ml,
终浓度为0.5mol/L。
5.1.3DNA提取液
1
DB63/T1479—2016
称取十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)8.0g,氯化钠32.7g,Tris-HCl盐酸溶液(0.5mol/L)10mL,
EDTA溶液(0.5mol/L)4mL,混合,再用去离子水定容至400mL。
5.1.4三氯甲烷和异戊醇混合液(24:1)
量取三氯甲烷240mL和异戊醇10mL,混匀,此溶液配制在通风橱进行。
5.1.570%乙醇
5.1.610倍DNA溶解液
Tris-HC溶液(0.5mol/L)10mL,EDTA溶液(0.5mol/L)2mL,先加入到50mL去离子水中,溶
解混合均匀,再定容至100mL,高温高压灭菌(121℃,15分钟),室温保存。
5.1.71倍DNA溶解液
取10倍DNA溶解液10mL,加入90mL去离子水,混匀。
5.2PCR扩增试剂
5.2.1dNTPs混合溶液
取浓度为100mmol/L的dATP、dCTP、dGTP、dTTP储存液各25μL混合,加入去离子水900μL,
配成终浓度为2.5mmol/L工作液。-20℃条件下保存。
5.2.2引物稀释
用去离子水配制引物浓度为100μM的储存液,取10μL储存液加人90μL去离子水配成10μM工
作液。
5.3聚丙烯酰胺凝胶试剂
5.3.15倍电泳缓冲液
分别称取Tris54.0g,硼酸27.5g,放于1000mL烧杯中,加入蒸馏水800mL,充分搅拌溶解,
再加入EDTA溶液(0.5mol/L)20mL,混匀,定容至1000mL。
5.3.230%丙烯酰胺
分别称取丙烯酰胺29.0g和甲叉双丙烯酰胺1.0g,并放于100mL烧杯中,加入蒸馏水80mL,充
分搅拌,定容至100mL,用滤纸过滤,于棕色瓶中4℃保存。
5.3.310%过硫酸铵
称取过硫酸铵0.100g,并放于1.5mL离心管中。加入蒸馏水1mL,充分震荡,于4℃冰箱保存,
保存期不超过7天。
5.3.41倍电泳缓冲液
取5倍电泳缓冲液500mL,加去离子水2000mL,混匀。
5.3.5加样缓冲液
2
DB63/T1479—2016
称量EDTA0.440g,溴酚蓝0.250g,二甲苯青0.025g,置于500mL烧杯中,向烧杯中加入去离
子水20mL,加热搅拌充分溶解,加入甘油18mL后,使用NaOH调节pH值至7.0,用去离子水定容至50mL,
室温保存。
5.4染色试剂
5.4.110mg/mL溴化乙锭
称量溴化乙锭0.50g,加入到200ml容器中,加入去离子水50ml,充分搅拌完全溶解溴化乙锭,
将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。
5.4.2凝胶染色液
取10mg/mL溴化乙锭溶液10μL,加入400mL的去离子水,混匀。
6引物
SSR引物见附录B。
7操作步骤
7.1试样制备
青海草地早熟禾种子单粒发芽成苗。
7.2DNA提取
DNA提取步骤如下:
a)将DNA提取液在65℃水浴中预热;
b)剪取长度为
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