WS/T 633-2018 巴贝虫检测 虫种核酸鉴定法
WS/T 633-2018 Babesia detection and species nucleic acid identification method
基本信息
发布历史
-
2018年09月
研制信息
- 起草单位:
- 起草人:
- 出版信息:
- 页数:13页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS11.020
C61
WS
中华人民共和国卫生行业标准
WS/T633—2018
巴贝虫检测虫种核酸鉴定法
DetectionofBabesiaspp.——Identificationofspeciesbynucleicacidmethod
2018-09-26发布2019-04-01实施
中华人民共和国国家卫生健康委员会发布
WS/T633—2018
前 言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由国家卫生标准委员会寄生虫病标准专业委员会提出。
本标准起草单位:中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所、复旦大学、第二军医大学。
本标准起草人:刘琴、周晓农、张仪、胡薇、陈家旭、朱淮民。
I
WS/T633—2018
巴贝虫检测虫种核酸鉴定法
1范围
本标准规定了检测巴贝虫的虫种核酸鉴定法。
本标准适用于各级疾病预防控制机构和医疗机构对巴贝虫的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
WS/T564巴贝虫病诊断
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
巴贝虫Babesiaspp.
一类寄生于人和脊椎动物红细胞内的原虫,可引起巴贝虫病(babesiosis)。感染人体的巴贝虫种
类主要有田鼠巴贝虫(Babesiamicroti)、分歧巴贝虫(B.divergens)、邓肯巴贝虫(B.duncani)和猎户
巴贝虫(B.venatorum)等(参见附录A)。
4仪器和器材
4.1高速离心机
最大相对离心力为12000×g。
4.2涡旋仪
无级调速范围为200r/min~3000r/min。
4.3PCR扩增仪
温度范围为4℃~99℃,温度精确为0.1℃,热盖为105℃。
4.4微波炉
4.5电泳仪
电压为5V~5000V,电流为1mA~500mA。
1
WS/T633—2018
4.6凝胶成像系统
镜头分辨率(H×V)为1360×1024,光源为透射UV。
5试剂和材料
5.1分子生物学试剂
Taq酶、脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)、分子质量指示物及核酸提取试剂盒选用商品化产品。
5.2化学试剂
Tris-乙酸电泳缓冲液(TAE)、琼脂糖凝胶、6×加样缓冲液(参见附录B)。
5.3引物
扩增巴贝虫18S核糖体RNA(18SrRNA)基因和转录间隔区(ITS)基因的特异性引物(见附录
C)。
5.4参照材料
阳性对照为田鼠巴贝虫peabodymjr株基因组DNA。
空白对照为去离子灭菌水。
阴性对照为健康人全血基因组DNA。
6检测步骤
6.1样品
样品为临床诊断或疑似巴贝虫病病例抗凝血样品。
6.2虫种核酸鉴定
6.2.1核酸提取
基因组DNA提取采用商品化全血DNA提取试剂盒(参见附录B)。
6.2.218SrRNA基因扩增
见附录C。
6.2.3ITS基因扩增
见附录C。
6.2.4结果判定
电泳分析
.1电泳
2
WS/T633—2018
取第二轮PCR产物5µL与1μL6×加样缓冲液混合,加样于含溴化乙锭替代物的1.0%琼脂糖凝胶
中,在1×TAE缓冲液中,5V/cm电泳约40min,当溴酚蓝到达底部时停止电泳,用凝胶成像系统或
紫外分析仪分析。
.2PCR结果判断
.2.1PCR扩增巴贝虫18SrRNA基因,出现大小为400bp左右特异性的扩增片段,空白对
照和阴性对照未出现条带,PCR结果阳性。PCR扩增巴贝虫18SrRNA基因,未出现大小为400bp左
右特异性的扩增片段,空白对照和阴性对照未出现条带,PCR结果阴性。
.2.2PCR扩增巴贝虫ITS基因,出现大小在700bp~2100bp的特异性的扩增片段,空白对
照和阴性对照未出现条带,PCR结果阳性。PCR扩增巴贝虫ITS基因,未出现特异性的扩增片段,空
白对照和阴性对照未出现条带,PCR结果阴性。
测序分析
阳性PCR扩增产物进行双向测序,将序列进行BLAST比对分析(见附录C)。
虫种鉴定
根据PCR扩增产物电泳结果与测序结果分析,综合判定虫种种类(见附录C)。
3
WS/T633—2018
AA
附录A
(资料性附录)
病原生物学
A.1分类
巴贝虫(Babesiaspp.)属于顶复门(Apicomplexa)、孢子虫纲(Sporozoa)、梨形虫亚纲
(Piroplasmasina)、梨形虫目(Piroplasmida)、巴贝虫科(Babesiidae)的巴贝虫属(Babesia)。目前
已鉴定的有100多种巴贝虫,可以感染牛、马、羊、犬等多种哺乳动物和鸟类。在100多种巴贝虫中,既
往已知可以感染人的巴贝虫种类主要有:田鼠巴贝虫(B.microti)、分歧巴贝虫(B.divergens)、邓肯巴
贝虫(B.duncani,也称为WA1)和猎户巴贝虫(B.venatorum,也被称为EU1)等。不同巴贝虫虫种引
起人体临床症状的比较见表A.1。
A.2分布
本病呈地方性流行。
在美国,巴贝虫病病例主要发现于马萨诸赛岛、纽约州、康涅狄格岛、加利福尼亚州以及罗得岛。
在欧洲,法国、葡萄牙、意大利、波兰、挪威等地均有人巴贝虫病病例发生。另外,在埃及、墨西哥、
澳大利亚、日本、韩国、巴基斯坦及南非也均有人巴贝虫病病例报道。
在我国云南、河南、新疆、山东、陕西、浙江、江苏、广西、福建及台湾、香港地区等地均有人巴
贝虫病病例报道。
表A.1不同巴贝虫虫种引起人体临床症状的比较
虫种地理分布媒介名称潜伏期临床特征其他
田鼠巴贝虫欧洲、美国、肩突硬蜱、1周~6周,甚至3大多数患者症状比较轻微,只出现一过一般以50岁以上
(B.microti)日本、中国、卵形硬蜱、个月以上性的发热症状;而重症患者出现疟疾样的老人易感
埃及等全沟硬蜱、症状,包括发热、寒战、肌肉疼痛、贫
丹敏硬蜱血、无力、肝脾肿大、溶血性贫血等
分歧巴贝虫欧洲篦子硬蜱1周~3周突然起病、血红蛋白尿、黄疸、休克样脾脏切除和免疫
(B.divergens)表现缺陷者易感
邓肯巴贝虫欧洲、美国丹敏硬蜱、3周~2个月发热、寒战、肌肉疼痛、贫血、无力、脾脏切除患者易
(B.duncani)等肩突硬蜱肝脾肿大、溶血性贫血,持续数周或更感;易输血传播
长
猎户巴贝虫欧洲、中国蓖子硬蜱、不明确大多数患者症状比较轻微,只出现一过免疫功能低下者
(B.venatorum)等卵形硬蜱性的发热症状;严重者表现贫血、血红或者脾切除患者
定制服务
推荐标准
- QB/T 2096.2-1995 桌虎钳 燕尾桌虎钳 1995-05-08
- FZ/T 90082.5-1995 有梭织机用层压木侧板和投梭棒物理力学试验方法 顺纹胶层抗剪强度 1995-01-24
- SJ 3002.1-1988 组合冲模 冲槽刃口 1988-03-28
- HB 5324-1993 航空用厌氧胶紫外荧光性试验方法 1993-11-05
- SJ/Z 9055-1987 纸或塑料打印色带-盘芯的规格 1987-10-30
- SJ 2994.2-1988 组合冲模 圆角刃口座 1988-03-28
- HB 4372-1989 矩形凹模毛坯 1989-07-12
- JB/T 7446.1-1994 立式辗环机 参数 1994-09-06
- HB 5539-1983 外套螺母 1984-08-23
- HB 1688-1987 强固长方形支承 1987-04-08