T/SAS 0026-2024 结核分枝杆菌菌株全基因组测序质量控制要求

ICS0710010

CCSC.05.

团体标准

T/SAS0026—2024

结核分枝杆菌菌株全基因组测序质量

控制要求

Qualitycontrolrequirementsforwholegenomesequencingof

Mycobacteriumtuberculosisstrain

2024-11-27发布2024-12-15实施

上海市标准化协会发布

中国标准出版社出版

T/SAS0026—2024

前言

本文件按照标准化工作导则第部分标准化文件的结构和起草规则的规定

GB/T1.1—2020《1:》

起草

。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利本文件的发布机构不承担识别专利的责任

。。

本文件由上海市标准化协会提出并归口

。

本文件起草单位上海市疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心上海华大医学检验所有限公

:、、

司中山大学公共卫生学院深圳上海市肺科医院浙江省疾病预防控制中心江苏省疾病预防控制中

、()、、、

心安徽省结核病防治研究所安徽省胸科医院

、()。

本文件主要起草人沈鑫张阳奕赵雁林江渊姜琳杨崇广余方友陈彬陈诚刘洁吴昊鲍方进

:、、、、、、、、、、、、

江晓丽李跃杨珺凯陈路阳

、、、。

本文件首批执行单位上海市疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心上海华大医学检验所有

:、、

限公司中山大学公共卫生学院深圳上海市肺科医院浙江省疾病预防控制中心江苏省疾病预防控

、()、、、

制中心安徽省结核病防治研究所安徽省胸科医院

、()。

Ⅰ

T/SAS0026—2024

结核分枝杆菌菌株全基因组测序质量

控制要求

1范围

本文件规定了结核分枝杆菌菌株全基因组测序质量控制要求包括实验室及生物安全要求菌株样

,、

本菌株提取基因文库构建高通量测序和数据质控步骤及最低要求

、DNA、、。

本文件适用于应用高通量测序技术对结核分枝杆菌菌株样本进行全基因组测序的质量控制

。

本文件不适用于半导体测序技术及单分子测序技术

。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款其中注日期的引用文

。,

件仅该日期对应的版本适用于本文件不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于

,;,()

本文件

。

分析试验室用水规格和试验方法

GB/T6682

实验室生物安全通用要求

GB19489

高通量基因测序结果评价要求

GB/T35537—2017

核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范

GB/T37875—2019

环境微生物宏基因组检测高通量测序法

GB/T40226—2021

用于病原微生物高通量检测的核酸提取技术规范

GB/T40458—2021

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件

。

31

.

基因组genome

一种生物体具有的所有遗传信息的总和

。

来源

[:GB/T30989—2014,3.2]

32

.

基因文库genelibrary

整套由基因组片段插入克隆载体获得的分子克隆的总和

DNA。

来源

[:GB/T30989—2014,3.7]

33

.

测序读长readlengthofgenesequencing

测序能测得的最长基因片段的长度通常以碱基数表示单位为