DB53/T 1057-2021 滇金丝猴肠道微生物组数据获取技术规程

ICS11.220

CCSB41

53

云南省地方标准

DB53/T1057—2021

滇金丝猴肠道微生物组数据获取技术规程

RegulationfordataacquisitionofgutmicrobiotaforRhinopithecusbieti

2021-09-30发布2021-10-14实施

云南省市场监督管理局发布

DB53/T1057—2021

目  次

前言...................................................................................................................................................................III

1范围.................................................................................................................................................................1

2规范性引用文件.............................................................................................................................................1

3术语和定义.....................................................................................................................................................1

4基本要求.........................................................................................................................................................2

4.1实验室通用要求.....................................................................................................................................2

4.2主要试剂及仪器设备.............................................................................................................................2

5样品采集和保存.............................................................................................................................................2

6滇金丝猴肠道微生物总DNA提取及检测....................................................................................................2

6.1试剂盒选取.............................................................................................................................................2

6.2肠道微生物总DNA提取.........................................................................................................................2

6.3肠道微生物总DNA质量检测.................................................................................................................2

7肠道微生物组高通量测序.............................................................................................................................2

7.1肠道微生物16SrRNA基因引物选取及扩增....................................................................................2

7.2肠道微生物16SrRNAPCR扩增产物电泳检测及纯化..................................................................3

7.3肠道微生物16SrRNA基因测序.........................................................................................................3

7.4肠道微生物宏基因组测序.....................................................................................................................3

8肠道微生物组数据获取.................................................................................................................................3

8.116SrRNA基因数据质控......................................................................................................................3

8.2宏基因组数据质控.................................................................................................................................3

8.3宏基因组数据去除宿主信息.................................................................................................................3

8.4肠道微生物组数据获取.........................................................................................................................3

附录A（规范性）主要试剂及仪器设备...................................................................................................4

附录B（规范性）粪便样品的采集和保存方法.......................................................................................5

附录C（规范性）总DNA样品的提取步骤、琼脂糖凝胶电泳检测及成像方法...................................8

附录D（规范性）16SrRNAPCR引物、反应体系、反应时间及产物纯化步骤..............................9

I

DB53/T1057—2021

前  言

本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起

草。

请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。

本文件由云南省林业与草原局、云南省市场监督管理局共同提出。

本文件由云南省林业标准化技术委员会（YNTC02）归口。

本文件主要起草单位：云南大学、云南省标准化研究院。

本文件主要起草人：于黎、黄艳梅、张志刚、朱勋程、李依恬、李宁、刘纯兵、徐志茹、姚雪沁、

胡靖扬、吴宏、匡卫民。

III

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滇金丝猴肠道微生物组数据获取技术规程

1范围

本文件规定了滇金丝猴（Rhinopithecusbieti）肠道微生