DB45/T 1856-2018 蛤蚧及其伪品COI条形码鉴别技术规程
DB45/T 1856-2018 Identification Technical Regulations for the COI Barcode of Gekko gecko and its Fakes
基本信息
发布历史
-
2018年10月
研制信息
- 起草单位:
- 起草人:
- 出版信息:
- 页数:16页 | 字数:- | 开本: -
内容描述
ICS65.020.30
B3838B
DB45
广西壮族自治区地方标准
DB1856—201845/T
蛤蚧及其伪品COI条形码鉴别技术规程
IdentificationofofIdentificationgeckoGekkoAdultandLinnaeusCOItheUsingerants
BarcodeBarcode
2018-10-20发布2018-11-20实施
广西壮族自治区质量技术监督局发布
DB45/T1856DB45/T—2018
目目次
前言................................................................................II................................................................................前言
11..............................................................................范围
21........................................................................术语和定义
32..........................................................................鉴别程序
附录A(规范性附录)蛤蚧伪品3........................................................
附录B(规范性附录)蛤蚧及其伪品DNACOI序列4........................................
I
DB45/T1856DB45/T—2018
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准按照GB/T
本标准由广西壮族自治区卫生和计划生育委员会提出。
本标准由广西卫生标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:广西壮族自治区药用植物园。
本标准主要起草人:徐永莉、李力、闫志刚、张月云、赵成坚、黄勇、谷颖乐。
III
DB45/T1856DB45/T—2018
蛤蚧及其伪品COI条形码鉴别技术规程
11范围
Gekkogecko本标准规定了蛤蚧(Gekko)及其伪品的COI条形码鉴别的术语和定义、鉴别程序。
本标准适用于广西境内蛤蚧及其伪品COI条形码的鉴别。本标准适用于广西境内蛤蚧及其伪品COI条形码的鉴别。
22术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.12.1
GekkogeckoGekko蛤蚧
GekkogeckoGekko蛤蚧()属爬行纲Reptilia、有鳞目Squamata、壁虎科Gekkonidae、壁虎属Gekko。蛤
蚧药材为除去内脏的干燥体。包括黑点蛤蚧和红点蛤蚧。
2.22.2
蛤蚧伪品蛤蚧伪品geckoGekkoadulterants
市场上当蛤蚧销售和使用的动物。详见附录A。
2.32.3
DNA条形码DNAbarcodingbarcodingDNADNA条形码
生物体内能够代表该物种的标准的、有足够变异的、易扩增且较短的DNA片段。生物体内能够代表该物种的标准的、有足够变异的、易扩增且较短的DNA片段。
2.42.4
COICOI
细胞色素c氧化酶亚基I(cytochromecoxidasesubunitI,COI),线粒体基因组的蛋白质编码基subunitoxidasec(cytochrome细胞色素c氧化酶亚基I
因。
2.52.5
COI条形码COIbarcodingbarcodingCOICOI条形码
集中存在于动物线粒体细胞色素C氧化酶亚单位I(COI)特定区段的一段大约有650个碱基的DNA序
列。
2.62.6
近邻相接法neighbor-joiningmethod(NJ法)method(NJ法)neighbor-joining近邻相接法
一种研究DNA而建立亲缘关系的方法,由序列建立支序图或亲缘关系图。
1
DB45/T1856DB45/T—2018
2.72.7
bpbp
碱基对。
33鉴别程序
3.13.1鉴别条件
PCR扩增仪、核酸电泳仪和水平电泳槽、凝胶成像系统、组织基因提取试剂盒、序列比对软件。
3.23.2引物序列
LCOI490:5'—GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG—3'。
HCO2198:5'—TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA—3'。
3.33.3DNA的提取
取药材样品,75%乙醇表面消毒,用灭菌手术刀,取样品皮下肌肉约30mg,剪碎,DNA提取研磨仪
研磨2min,用组织基因提取试剂盒提取总DNA,提取步骤参见各产品使用说明书。
3.43.4PCR扩增
反应体积为25μL,所加试剂包括5U/μLTaqDNA聚合酶(TaKaRa)0.5μL,10mmol/LdNTP1μL,
10pmol/μL上下游引物各0.5μL,10×buPCRffer2.5μL,Mg2+1.5μL,DNA模板1μL。PCR反应在PCR
扩增仪上进行,反应参数为:95℃3min,(94℃45s,55℃45s,72℃45s)×39,72℃5min,4℃
保存。
3.53.5电泳
将PCR产物5μL与上扬染料3μL混合,加入1.5%琼脂糖凝胶的点样孔中,同时设100bp梯度DNA标准
分子量作为片段大小的标准。100V电压电泳约40min。
3.63.6成像及分析
将电泳后的琼脂糖凝胶置于凝胶成像系统观察窗内,观察分析并成像保存。
3.73.7DNA样品测序
凝胶上出现一条600bp大小的特异性条带PCR扩增产物用试剂盒对PCR扩增的样品进行纯化,纯化的
步骤参见各产品使用说明书,将检测纯化后的样品进行测序。
3.83.8鉴别
将所得序列经计算机拼接辅以人工校对,采用Biast序列相似性搜索比对,蛤蚧COI5’端序列,即
蛤蚧DNA条形码序列,562bp的长度用于种间水平的分析。蛤蚧同其伪品间的序列差异为6.0%~64.0%,
平均序列差异为35.0%。通过NJ法并利用实验序列和GenBank序列所构建系统聚类树。基于COI序列构建
的NJ树将蛤蚧与伪品区分。
2
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AA
附附录A
(规范性附录)(规范性附录)
蛤蚧伪品蛤蚧伪品
Gekkoswinhonis无蹼壁虎Gekko、中国瘰螈chinensisParamesotriton、多疣壁虎japonicusGekko、睑
虎Goniurosauruslichtenfelderi、西藏沙蜥Phrynocephalustheobaldi、红瘰疣螈Tylototriton
verrucosus、kweichowensis贵州疣螈Tylototriton、喜山岩蜥Laudakiahimalayana树蜥Calotes、变色
versicolor、青海沙蜥Phrynocephalusvlangalii、pinchonii山溪鲵Batrachuperus、东方蝾螈Cynops
orientalis等。
3
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BB
附附录B
(规范性附录)(规范性附录)
蛤蚧及其伪品DNACOI序列
B.1B.1蛤蚧chinensisGekko562bp
gaattaagtcaaccaggagcactccttggaaacgaccaactatacaatgtaatcgtaacagcacacgcatttgtaataat
cttctttatacttctttatagtgatgcctgttataatcggggggtttggcaattgattagtccccctaataattggcgcaccggacatag
cttttccacgaataaacaacataagcttctgactgctccccccagcattattcctcctactagcctccgcgagtgtgga
agctggggcggggacaggatgaactgtataccccccactagcagctaatctagcacatgcaggcgcatctgtagacctggc
catcttttcccatcttttccttacacctagctggagtctcttccatcttaggggccatcaattttatcaccacctgcattaatataaaac
ccccaagcataacccaatacacgacacccctgtttgtatgatcggttctaattactgccgtactacttctcctagcacta
ccagtgcttgccgccggcactatactcatgctgaccgaccgtttcacatcattctaaccttaagaccctgccggaggcgggg
B.2B.2无蹼壁虎swinhonisGekko825bp
atgtttacccgttgatttctctcaacaaaccataaagacattggcaccctatatttactgtttggtgtatgagccggcat
agtgggcacagcactgagcttgttaattcgcgcggagttaagccagcctggggcactactaggggatgatcagatctata
atgttatcgtaacagcccatgcattcgtaataattttttttatagtcatgcccgttataattggcggcttcggcaattga
cttgtaccacttataattggcgcacccgatatggcttttccacgaatgaataatataagtttttgactgctcccaccatc
actgctactacttctcgcttcttccggagttgaagcaggtgctggaaccggttgaactgtctatcccccattagcagcta
atcttgcacatgcgggcgcatcagttgacctagttattttctctctacatttggcaggtgtatcttcaatcttaggggct
atcaattttaatcaattttatcaccacctgcattaatataaaatctactgccatgtcgcagtacaatacgcccctatttatttgatcggt
attaattaccattaattaccgccgtactactcttacttgccctaccggttctggctgccggaattactatacttctaaccgaccgcaacc
ttaacactacttaacactacattctttgaccctgcggggggcggagatcctgtactatatcaacacctattctgattttttgggcaccca
gaagtatatattttaattcttcccggattcggcatagtatcgcatatcattacgtactatgcaggaaaaaaagaaccgtt
cggctacatggggatagtctgggct
B.3B.3中国瘰螈chinensisParamesotriton2690bp
gttaaggtggcagagcccggtaattgcaaaagacctaagccctttccaccagaggttcaattcctcttcttaactgtgta
tactatatcctactatatccgccctcttaaacccattactatatattatcccagtattattagccgtggcctttttaactcttgttgaac
gaaaagtactagggtatatacaactgcggaaaggaccaaacatagtggggccagtaggccttcttcaaccaatcgcagat
ggactaaaactatttattaaagaacccgtacgcccatcaacatcgtcacaaactctgtttctcattatacccataatagc
gctaactctggcactaattatttgaatcccactacccatgccctttacactgtctaatctaaatctgggggttcttttcc
ttctatccctttctatccctatctagcctg
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