T/CPMA 010-2020 基于高通量测序的病原体筛查通用准则

ICS07100

CCSC.01

团体标准

T/CPMA010—2020

基于高通量测序的病原体筛查通用准则

Generalcriteriaforpathogenscreeningbasedonhigh-throughputsequencing

2020-07-01发布2020-10-01实施

中华预防医学会发布

T/CMPA010—2020

目次

前言

…………………………Ⅲ

范围

1………………………1

规范性引用文件

2…………………………1

术语和定义

3………………1

试验方法

4…………………2

技术指标

5…………………3

附录规范性附录实验室功能分区

A()…………………6

Ⅰ

T/CMPA010—2020

前言

本标准按照给出的规则起草

GB/T1.1—2009。

本标准由中华预防医学会归口

。

本标准起草单位中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京化工大学和中国医学科学院病原

:、

生物学研究所

。

本标准主要起草人张雯童贻刚任丽丽韩娜肖艳安小平王媛媛

:、、、、、、。

Ⅲ

T/CMPA010—2020

基于高通量测序的病原体筛查通用准则

1范围

本标准规定了呼吸道样本鼻咽拭子鼻咽吸取物痰液肺泡灌洗液等消化道样本粪便肛拭

(/、、、)、(、

子等活检组织生物体液样本脑脊液血液胸腹水等虫媒样本环境样本等类型样本的病原体高

)、、(、、)、、

通量测序筛查通用准则

。

本标准适用于开展基于高通量测序的病原体筛查的实验室

。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于本文件

。,()。

病原微生物实验室生物安全通用准则

WS233—2017

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件

。

31

.

文库library

由两端连有已有的特定序列中间为未知序列的核酸片段组成的核酸分子的集合

,。

32

.

高通量测序high-throughputsequencing

以一次并行几十万到几十亿条甚至更多核酸分子序列测定为标志适用于或的测序

,DNARNA

技术

。

33

.

病原体pathogens

致人类或动植物感染性疾病的生物总称包括细菌病毒寄生虫真菌等微生物或其他生物体

,、、、。

34

.

筛查screening

通过某种方法手段对导致人群疾病的可能的因素进行查找

。

35

.

核酸序列数据库nucleotidedatabase

按照数据结构来组织存储和管理核酸序列的数据仓库

、DNA/RNA。

36

.

靶向测序targetedsequencing

检测特定基因集或基因组区域内已知和新型变异的测序方法

。

37

.

鸟枪法测序shotgunsequencing

随机测序随机将分解成小片段并将小片段进行测序获得序列片段的方法

DNA,。

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