GB/T 28978-2012 马铃薯环腐病菌检疫鉴定方法
GB/T 28978-2012 Detection and identification of Clavibacter michiganensis subsp.sepedonicus
基本信息
本标准适用于马铃薯环腐病菌在马铃薯块茎、植株上的检测与鉴定。
发布历史
-
2012年12月
研制信息
- 起草单位:
- 中华人民共和国厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心、中华人民共和国福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心、中华人民共和国浙江出入境检验检疫局
- 起草人:
- 廖富荣、林石明、吴媛、沈建国、吴志毅、陈青、张明哲、陈红运、黄蓬英
- 出版信息:
- 页数:21页 | 字数:37 千字 | 开本: 大16开
内容描述
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中华人民共和国国彖标准
GB/T28978—2012
马铃薯环腐病菌检疫鉴定方法
DetectionandidentificationofClavibactermichiganensissubsp.sepedonicus
2012-12-31发布2013-06-01实施
GB/T289782012
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本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口。
本标准起草单位:中华人民共和国厦门出入境检验检疫局检验检疫技术中心、中华人民共和国福建
出入境检验检疫局检验检疫技术中心、中华人民共和国浙江出入境检验检疫局。
本标准主要起草人:廖富荣、林石明、吴媛、沈建国、吴志毅、陈青、张明哲、陈红运、黄蓬英。
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GB/T289782012
马铃薯环腐病菌检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了基于生理生化特性、致病性特征、血清学、分子生物学特征的马铃薯环腐病菌检测和
鉴定方法。
本标准适用于马铃薯环腐病菌在马铃薯块茎、植株上的检测与鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
SN/T1135.5—2007马铃薯环腐病菌检疫鉴定方法
3马铃薯环腐病菌基本信息
中文名称:密执安棒状杆菌环腐亚种
俗名:马铃薯环腐病菌
拉丁学名tClavibactermichi^anensissubsp.sel)edonicus
属于微杆菌科(Microbacteriaceae、棒形杆菌属(Clavibacter)的成员。
马铃薯环腐病菌(以下简称Cms引起马铃薯环腐病,可通过带病的种薯进行远距离传播,也报道
可通过番茄等种子传播,关于Cms的其他信息参见附录A。
4方法原理
马铃薯环腐病菌具有独特的培养性状和生理生化特征,该病菌的生理生化特性、致病性特征,以及
血清学、分子生物学特征是制定本标准的主要依据。
5主要仪器设备
本标准的检测鉴定方法主要使用以下仪器设备:
微量榨汁机、酶标仪、洗板机、微量天平(感量:0.001g、生物培养箱、荧光显微镜、PCR仪、荧光
PCR仪、电泳仪、水平电泳槽、凝胶成像仪、高速冷冻台式离心机、BI()L()G自动微生物鉴定系统、浊度
计、水浴槽或恒温孵育器、pH计、各种量程的可调移液器(1000卩L、200卩L、100卩L、20MU10”L、2(«L0
6检测与鉴定
6.1症状检查
马铃薯环腐病菌侵染马铃薯植株后,在马铃薯块茎、植株上可产生症状(参见附录A),通过症状检
查可以初步判断是否为Cms引起的病害。
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GB/T289782012
6.2表现症状样品中病原菌的分离
6.2.1培养基的选择
从马铃薯块茎、茎杆、叶片等植物组织中分离病原菌选择用MTNA培养基(见B.1)或NCP-88培
养基(见B.2),用酵母葡萄糖矿物盐培养基(YGM)(见B.3)或葡萄糖营养琼脂(NDA)(见B.4)进一步
纯化。
6.2.2分离纯化
按附录C给出的方法,从发病的植物组织中分离病原菌。当分离到疑似Cms的纯培养后,6.4~
6.6给出的方法进行鉴定,然后6.7给出的方法进行致病性测定。
6.3潜伏侵染样品初筛与分离
6.3.1样品制备
按附录D的给出的方法,每份检测样品取200个马铃薯块茎,洗涤去除表面土壤后,切取维管束组
织制备马铃薯块茎悬浮液。
6.3.2初筛检测
利用DAS-ELISA方法(6.5给出的方法)对制备马铃薯块茎悬浮液进行初筛检测。如果DAS-
ELISA检测结果为阳性的,则用RT-PCR方法(6.6.1给出的方法)进行验证。
6.3.3生物学测定
把初筛检测阳性的马铃薯块茎悬浮液接种到感病的茄子上,进行生物学测定(6.7给出的方法)。
6.3.4分离纯化
按附录C给出的方法,把初筛检测阳性的马铃薯块茎悬浮液进行系列稀释(10-\10^2JO"3),分
别取100卩L涂布到MTNA培养基(见B.1)或NCP-88培养基中(见B.2)上进行分离培养。
对疑似Cms菌落6.4—6.6给出的方法进行鉴定,然后6.7给出的方法进行致病性测定。
注:分离纯化可以和生物学测定平行进行。
6.4BIOLOG鉴定
按附录E给出的方法,把疑似Cms的纯培养接种到BUG培养基(见B.7)上富集培养,然后接种到
GENHI鉴定板上进行鉴定。
6.5DAS-ELISA检测
对于表现症状的植物组织样品,1:10的比例(质量:体积)在检测样品中加入样品提取缓冲液
(见B.10),研磨成匀浆后,离心,上清液作为检测样品。
对于已分离纯化的细菌纯培养,用样品提取缓冲液(见B.10)制备约106CFU/mL的菌悬液作为
检测样品。
对于潜伏侵染的植物组织样品,制成样品悬浮液后(见附录D),用样品悬浮液进行检测。
按试剂操作说明书或SN/T1135.5—2007中5.2给出的试验方法。用Cms已知菌株作阳性对
照,并设置相应的阴性对照。
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GB/T28978—2012
6.6分子生物学检测
6.6.1PCR检测
本标准提供多个检测Cms的PCR方法.任意选用其中一种PCR法进行检测,F.1和F.2给出
的方法。用Cms已知菌株作阳性对照,并设置相应的阴性对照和空白对照。
6.6.2实时荧光PCR检测
本标准提供2个检测Cms的实时荧光PCR方法,任意选用其中一种方法进行检测,F.1和F.3
给出的方法。用Cms已知菌株作阳性对照,并设置相应的阴性对照和空白对照。
6.7致病性测定
按附录G给出的方法,把培养3d的纯培养物制备成约106CFU/mL菌悬液,接种到5~10株茄子
幼苗的茎杆上。用新鲜配制的马铃薯环腐病菌已知菌株制备成约O5CFU/mL〜10”CFU/mL的菌悬
液作为阳性对照,接种5株茄子幼苗。用无菌水作为阴性对照,接种5株茄子幼苗。
7结果判定与报告
7.1结果判定
7.1.1当BIOLOG检测或DAS-EILS检测或分子生物学检测(PCR方法或实时荧光PCR方法),其中
两种基于不同原理的方法检测结果为阳性、且致病性测定为阳性时,判定为马铃薯环腐病菌。
7.1.2当DAS-EILSA检测或分子生物学检测(PCR方法或实时荧光PCR方法)初筛检测结果为阴
性,或只有其中一种检测方法结果为阳性时,判定为非马铃薯环腐病菌。
7.2结果记录与保存
7.2.1记录各项实验数据,包括样品种类、来源,检测时间、地点、方法和结果等。DAS-ELISA检测结
果保存吸光值的数据报告,PCR检测结果保存电泳照片,实时荧光PCR检测结果保存采集的数据。
7.2.2检出马铃薯环腐病菌的马铃薯块茎、茎秆、或叶片等样品,在超低温冰箱中保存,以备复核;分离
纯化的马铃薯环腐病菌保存到超低温冰箱中,或冻干后低温保存。
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附录A
(资料性附录)
马铃薯环腐病菌相关信息
A.1名称与分类地位
中文名称:密执安棒形杆菌马铃薯环腐亚种、密执安棒形杆菌环腐亚种、密执安棍状杆菌环腐亚种
拉丁名称:C7ap“ac/ermichi^atietisissubsp.sepedonicus(Speeckermann&Kotthof,1914
Davis,Gillaspie,Vidaver&Harris1984.
同物异名:Co厂iwebac/e?""加michi^anensissubsp.sepedonicum(SpieckermannKotthof,1914
Carlson&Vidaver,1982;CorynebacIeriuininichi^anensispv.sepedtmicuin(Spieckermann&
Kotthof,1914Dye&•Kemp1977;Corynebacteriumsepedonicum(Spieckermann&Kotthof,1914
Skaptason&Burkholder1942.
俗称:马铃薯环腐病菌
英文名称:Potatoringrot;bacterialringrotofpotato;ringrotofpotato;vascularpotatowilt
英文缩写:CMS或Cms
分类地位:细菌界(Bacteria,厚壁菌门(Firmicutes,放线菌纲(Actinobacteria,放线菌亚纲(Acti-
nobacteridae,放线菌目(Actinomycetales,微球菌亚目(Micrococcineae,微杆菌科(Microbacteriaceae),
棒形杆菌属CClavibacter')
A.2症状特征
A.2.1马铃薯块茎
A.2.1.1马铃薯块茎上的症状
块茎外部症状不明显,但横切后可看到维管束变为乳黄色以至黑褐色,重病薯维管束变色部分可连
成一圈、成环状,严重时皮层与髓部可以脱离。腐烂通常是从顶端的维管组织到块茎的中心皮层逐步发
展的。用手挤压切开的病薯,可看到维管束部分有乳白色或黄色菌液流出。经越冬贮藏的病薯,芽眼干
枯变黑或外表开裂。在病害晚期,由于次生菌的进一步侵染,维管束也可变黑并腐烂。
A.2.1.2与青枯病(褐腐病)的区别
与茄科劳尔氏菌(Ralstojiiasolanacearum)引起的青枯病(褐腐病)区别在于:在病害早期,马铃薯
环腐病腐烂组织通常保持乳白色、具粘稠的奶酪状特征,而马铃薯褐腐病腐烂组织呈褐色、更加粘稠、软
泥状。
A.2.1.3与黑茎病的区别
与胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种(Erwiniacarotovorasubsp.atroseptica)引起的黑茎病区
别在于:黑茎病在块茎上腐烂成粘团状,腐烂始于脐部,呈放射状向髓部扩展,病部黑褐色,横切可见维
管束亦呈黑褐色,用手压挤皮肉不分离,湿度大时,薯块变为黑褐色,腐烂发臭。
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GB/T289782012
A.2.2马铃薯植株
A.2.2.1马铃薯植株上的症状
在田间,马铃薯环腐病在植株上的症状有时很少被发现,经常只出现在季节的末期。该症状很容易
被其他病害、衰老或机械损伤等混淆,所以在现场检验时很容易被遗漏。马铃薯环腐病引起萎鳶症状很
少出现,只是叶片和块茎变小,偶尔植株矮化。环腐病引起萎蔦通常是缓慢的,最初只局限于叶缘。感
染的嫩叶经常依旧展开,造成不成对的叶片。受侵染的叶片木质部堵塞,经常在脉间区域产生褪绿、黄
色到橙色,进一步向下影响到茎杆。受感染的小叶、叶片、甚至茎杆,最终可能死亡。
A.2.2.2与其他病害的区别
茄科劳尔氏菌、胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜软腐亚种、胡萝卜软腐欧文氏菌马铃薯黑胫亚种
(E.carotovorasubsp.atroseptica)、菊欧文氏菌(E.chrysatithem,)、孔状短小茎点霉(Phomaexigua
var.foveala)等系统性病原也可以引起萎鳶症状,与马铃薯环腐病菌引起的萎薦症状的区別是:
——菊欧文氏菌侵染可以使茎杆变黑,而马铃薯环腐病菌不会使茎秆变黑。
一其他几种病菌引起的萎蔦症状是使整个叶片或整个植株快速萎蔦,而马铃薯环腐病菌不会引
起快速萎蔦。
A.3寄主范围
在自然条件下,只侵染马铃薯(.Solanurntuberosum)0甜菜(%/a-vulgaris}被认为也是该病菌的自
然寄主,但不表现症状。人T接种可以侵染西红柿(Lycopersiconesculentum)茄子(Solanummelon-
gena)、酷栗番茄(Lycopersiconpi/npi?ielIifolium^)等茄科(Solanaceae植物,并都表现症状。
A.4分布
欧洲:奥地利、白俄罗斯、塞浦路斯、捷克共和国、丹麦、爱沙尼亚、芬兰、德国、希腊、拉脱维亚、立陶
宛、荷兰、挪威、波兰、罗马尼亚、俄罗斯、斯洛伐克、瑞典、乌克兰、英国。
亚洲:中国、日本、哈萨克斯坦、韩国、朝鲜、尼泊尔、乌兹别克斯坦。
非洲:阿尔及利亚。
北美洲:加拿大、美国。
A.5形态特征
菌体棍棒状,球形,或卵圆形,单生或双呈“V”形,有时排列成栅栏状,大小(0.4艸〜0.6(«m)X
(0.8Mm~1.2Mmo不产生芽抱,无荚膜,无鞭毛,不能运动。该病菌革兰氏呈阳性,老龄菌易变为阴性。
A.6培养性状
该病菌生长最低温度1°C〜2°C,最高温度31°C〜33°C,生长最适温度为20°C〜23°C,在温度
55工条件下经10min致死,生长最适pH值为&0〜&4。该病菌具有生理分化现象。
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GB/T28978—2012
A.7生理生化特性
马铃薯环腐病菌的生理生化特征见表A.lo
表A.1用于马铃薯环腐病菌鉴定的营养和生理性状特征
测试反应
氧化发酵测试(Oxidativeandfermentativetest>O/F惰性的或微弱的氧化反应
氧化酶测试(Oxidasetest一
过氧化氢酶测试(Catalasetest+
硝酸还原反应(Nitratereduction一
咏酶活性(Ureaseactivity一
H2S的产生(H?Sproduction
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