GB/T 36820-2018 甘蔗条纹花叶病毒实时荧光反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测方法
GB/T 36820-2018 Detection method of Sugarcane streak mosaic virus by real-time reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR)
基本信息
本标准适用于可能带有甘蔗条纹花叶病毒的活体寄主植物的快速检测、诊断。
发布历史
-
2018年09月
研制信息
- 起草单位:
- 福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心、农业部甘蔗及制品质量监督检验测试中心、农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室
- 起草人:
- 高三基、黄美婷、傅华英、孙生仁、张慧丽、王锦达、陈如凯
- 出版信息:
- 页数:9页 | 字数:16 千字 | 开本: 大16开
内容描述
ICS65.020.01
B16
国
中华人民共和国国家标准
GB/T36820-2018
甘震条纹花叶病毒实时荧光反转录聚合酶
链式反应(RT-PCR)检测方法
DetectionmethodofSugαrcanestreαkmosαicvirusbyreal-timereverse
transcriptionpolymerasechainreaction(RT-PCR)
2018-09-17发布2019-04-01实施
国家市场监督管理总局峪非
中国国家标准化管理委员会0(..'I(J
GB/T36820-2018
目u昌
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本标准由全同植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出井归口。
本标准起草单位:福建农林大学同家甘煎t程技术研究中心、农业部甘服及制品质量监督检验测试
中心、农业部福建廿班生物学与遗传育种重点实验室。
本标准主要起草人:高三基、黄美婷、傅华英、孙生f:、张慧丽、王锦达、陈如凯。
I
GB/T36820-2018
甘蕉条纹花叶病毒实时荧光反转录聚合酶
链式反应(RT-PCR)检测方法
1范围
本标准规定了甘煎条纹花叶病毒(Sugaγα111P写lreahmοsC1itvirus)实时荧光反转录聚合陪链式反
应(RT-PCR)检测方法的仪器与设备、试剂与材料、样品的采集与前处理、检测以及结果判断与表述等。
本标准适用于可能带有it煎条纹花叶病毒的吊体寄主植物的快速检测、诊断。
2缩略i吾
下列缩略语适用于本文件。
CP:外壳蛋白(coatprotein)
Ct值:实时荧光PCR反应中,每个反应管内的荧光信号达到设定的阔值时所经历的循环数(cycle
threshold)
cDNA:与RNA链互补的单链DNA(complementaryDNA)
ExTaqHS酶:热启动DNA聚合鸭山otstartDNApolymerase)
FAM,6-援基荧光素(6-carboxy-fluorcscein)
PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)
RNA:核糖核酸(rihonucleicacid)
RT-PCR:反转录聚合隅链式反应(reversetranscriptionpolym巳rasechainreaction)
SCSMV:Itl[条纹花叶病毒(SuJ.;(ffC(/1/Pstrpa企mο川icvir川)
TAMRA,6-援基匹i甲基罗丹明(6-carboxytctramcthyIrhodamine)
Tip:吸头
3方法原理
根据甘煎条纹花叶病毒CP基因序列设计一对仅在该病毒CP基因间保守的特异性引物和一条特
异性的荧光双标记水解型寡核背酸探钊(TaqMan探告|)。首先利用反转录隅将病毒RNA反转成
cDNA,再以cDNA为模板在同一反应管内连续进行实时荧光PCR扩增反应,水解型寡核背酸探针
(TaqMan探针’)的荧光信号强度伴随着目标序列PCR扩增产物的增加呈正比关系,通过收集PCR扩
增过程的荧光信号值,即可判断试样是再带有目标序列。1干荒条纹花叶病信息参见附录A。
4仪器与设备
4.1实时荧光PCR检测仪:激发/检测波长范围350nm~750nm;可用荧光染料(SYERGreenI)和水
解型寡核二日=酸探针(TaqMan探钊);fl·阵泪速度注2.0。'C/s;均一性+/一0.5℃;准确性十/-0.3℃;泪
度范围4。C~100℃。
4.2核酸蛋向分析仪或紫外分光光度计。
4.3电子天平:感量0.01g。
GB/T36820-2018
4.4高速台式冷冻离心机:离心力12OOOg以上。
4.5微量加样器:0.1,uL~2.5/..tL、0.5µL~10µL、2µL~20µL、10µL~100µL、20,uL~200µL、
50µL~1000,uL。
4.6元核酸雨(Nuclease)的1.5mL、2.0mL离心管,PCR反应管、带滤芯Tip头、实时荧光PCR反
应管。
4.7恒温水恪锅。
4.8鼓风干燥箱。
4.9冰箱:2℃~8℃、-20℃、-80℃。
4.10生物安全柜。
4.11采样T具:砍刀、剪刀、慑子、带槽钻子。
5试剂与材料
5.1试剂
除非另有规定外,在分析中仅使用分析纯试剂,实验用水符合GB/T6682的二级水指标,其中涉及
PCR的用水要求达到一级水指标。
5.1.1氯仿。
5.1.2异丙醇。
5.1.3元水乙醇。
5.1.4元核酸陌(Nucl巳ase)水。
5.1.5裂解液:主要成分为异硫氨酸肌和苯酣,为RNA提取试剂。
5.1.675%乙醇。
5.1.7定量荧光PCR检测寻|物
5'刁|物:5’-CGGGAAACCCATAATACCAC-3'。
3'-引物:5’-GTCGATTTCTGCTGGTGAGA-3'"
扩增片段大小为130bpo
5.1.8水解型寡核轩酸探制(TaqMan探针)
51-FAM-TGCTGCATTGATTTCGT
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