T/LTIA 13-2021 基因检测服务中微生物组数据共享规范

范围:本文件规定了在基因检测服务中，微生物组在数据处理节点间的数据共享规范、元数据及数据交换格式。 本文件适用于基因检测服务中微生物组数据; 主要技术内容:在本标准制定过程中，随着研究的深入，先后完成标准讨论稿、草案和标准征求意见稿，标准内容不断完善，并趋于科学合理。根据需要，本标准的主要技术内容确定为：在术语和定义中，对元数据，微生物组，宏基因组学，扩增子，生物观测矩阵格式，数据生产，数据分析，分析级数据，数据存储，数据服务，基因丰度，分类学丰度，功能丰度，相对丰度，操作分类单元，FASTQ格式，TSV格式等进行了定义。在微生物组数据共享和交换流程中，描述了微生物组数据的生产、传输、使用等过程。将此过程分为四个环节：数据生产、数据分析、数据存储和数据服务，并描述各环节细节及注意要点。在微生物组数据元数据中，标准根据数据产生的环节，将元数据分为：样本信息关联的元数据、测序数据关联的元数据和分析级数据关联的元数据三个部分，规范了各部分微生物组数据交换中的常用元数据和最低要素。在微生物组数据格式中，标准规范了微生物组数据在各个过程环节中的数据格式，介绍了常用格式作为参考。根据产生的环节，微生物组数据分为原始数据和分析级数据。高通量测序方法的原始数据为FASTQ，分析级数据指原始数据经生物信息学方法分析所得的微生物组成分组成信息，并提出TSV（制表格分割文本）和BIOM格式可作为分析级数据文件存储使用的文件格式。此外，也提出了在网络交互场景下的建议数据结构